不同品种之间的交配

品种改良，一般最常用的手法就是以不同品种交配而期望产出具有双方之中间形质的品种，又对某一品种赋予另外一种优秀特性的手法亦属同一道理。例如，以德国种来交配，试行表现优秀的形质就是其一例。

在不同品种之间交配时，有时其优秀种鲤仅仅在第一代杂种产出，其后就消失不再见，有时其新的优秀特性会遗传至次一世代以后。如果是以出现一次为心满意足，第一代杂种产出后就消失不再现亦并无不可，可是欲改良品种就必须可遗传至次一世代为要。不同品种之间的交配，产出优秀鲤的机率很低，要育成到品种需经年累月，就锦鲤生产经营方面来说，投机性的要素很多，不能将生产之大部分投入此种方法。而且所使用的亲鲤，如何选定亦为一个问题。使用血统明确的亲鲤，确定欲产出的目标品种，然后选取亲鲤施行交配，否则优良品种就只期望突然变异一样的机率出现而已。非仅斑纹方面，连发育成长快慢、抗病力强、容易近人等一切观点，都予以利用来改良锦鲤体质为要。

同一品种之间的交配

在同一品种之间，使用优秀的亲鲤交配以产出锦鲤时，其目的大约如下：

（1)欲产出更加优秀的锦鲤。追求具有特优形质可能产出某一特定品种之极品鲤，将其形质代代传承给子孙，不在乎数量，产出数少亦无妨。

（2)欲产出能产生好体型之多产品种追求具有更好形质的好体型锦鲤，并提高其产出率同时又要使产出率固定，这正是生产业者要稳定其经营最重要的一环，并不是业余人员可企求的课题。

（3)欲矫正血统。以血统明确的红白为例，现有品种之中的某一血统，由于杂交而血统已紊乱了，纯种的红白已不可能由外表鉴识了。矫正血统一事，在品种改良上是非常重要的。以同一品种之间的交配来施行品种改良，有上述三个目的，如果这三个目的能同时达成是最为理想。在不同品种之间的交配，问题之关键在乎亲鲤的形质，但在遗传学研究上所必需的就是纯种血统之探究。亦即一方面施行多数同一品种之间的交配，一方面选取而饲养杂质较少的交配群。如此，或许血统就能逐渐矫正。